Au sein de l'UMR RESTORE, les travaux de l'EFS portent sur les cellules stromales mésenchymateuses (CSM). Plus spécifiquement, il s'agit de 

• comprendre le fonctionnement des CSM au sein des organismes, en situation physiologique et au cours du vieillissement,
• de comprendre les interactions CSM-cellules myéloïdes et
• étudier leur rôle dans les équilibres tissulaires et dans le développement de certaines pathologies inflammatoires et enfin d'explorer différentes applications basées sur l'utilisation de structures pluricellulaires en 3 dimensions (3D) dénommés organoïdes (ex. développement de modèle 3D de moelle osseuse).

L'équipe dirigée par Michel Cogné s'intéresse à l'immunologie et l'immunopathologie de la cellule B. Les travaux les plus récents portent plus spécifiquement sur l'analyse des éléments régulant la transcription et la recombinaison génétique des Ig.

L’UMR Right, unité de recherche « Interactions Hôte-Greffon-Tumeur & Ingénierie Cellulaire et Génique » s’intéresse aux relations immunologiques entre un patient et son greffon ou sa tumeur. Une meilleure compréhension de ces interactions permet le développement de nouveaux traitements basés sur des approches de thérapie cellulaire et génique pour moduler le système immunitaire afin de l’empêcher de rejeter un greffon ou au contraire le rendre plus apte à éliminer une tumeur. L'unité s’intéresse aussi à la modulation des maladies inflammatoires chroniques par des approches de biothérapies ainsi qu'à l’identification des biomarqueurs dans les maladies inflammatoires chroniques et les cancers.

L'équipe EFS dirigée par Philippe Saas s’intéresse à développer des approches d’immunothérapie basées sur les cellules dendritiques et à réaliser l’analyse de ces cellules et des effecteurs du système immunitaire (biomonitoring) dans les maladies inflammatoires chroniques que sont les cancers, les maladies infectieuses, et la transplantation. Les compétences développées autour des cellules dendritiques permettent aussi d’analyser leurs interactions avec les produits sanguins (notamment les vésicules extracellulaires issues des globules rouges et celles issues du microbiote) ou dans un contexte d’exposition aux polluants.